15 сентября 2014 года на заседании Ученого совета Тюменского госуниверситета ректором Валерием Фальковым было объявлено об окончательном этапе реорганизации трех вузов: к Тюменскому госуниверситету присоединили Тобольскую социально-педагогическую академию им. Д.И. Менделеева и Ишимский педагогический институт им. П.П. Ершова. Эти два вуза приобрели статус филиалов Тюменского госуниверситета.В Тобольском филиале на должность исполняющего обязанности руководителя назначена Короткова Елена Анатольевна (доктор педагогических наук, профессор). В Ишимском исполнять обязанности руководителя останется Шилов Сергей Павлович (доктор исторических наук, профессор).
ТюмГУ имеет большой опыт работы с филиалами. Но присоединенные вузы отличаются от предыдущих структурных подразделений по качественным и по количественным характеристикам. Это неизбежно приведет к переменам в самом Университете.